輸入事後調査 流れ 通知 修正申告 書類 対応

輸入事後調査の流れ

あなた、通知後の修正申告で5％増えることがあります。

輸入事後調査の流れと全体像

輸入事後調査は、輸入後に税関が納税申告の適正性を確認する税務調査で、輸入者の事業所などを訪問し、契約書、仕入書、会計帳簿、通関書類を見て申告内容を確認します。これは通関後に終わる話ではありません。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)
流れで見ると、原則として事前通知、実地調査、結果説明、修正申告または更正処分という順です。つまり後半が本番です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
実地調査では、必要に応じて取引先への反面調査や、Web会議システムを使う確認も行われます。訪問だけとは限りませんね。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)

通関現場では、輸入許可が出た案件は一段落と捉えがちです。ですが税関は通関後に改めて納税申告の正確性を見ます。結論は継続管理です。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)
財務省公表ベースでは、令和6事務年度に調査対象となった3,609者のうち2,690者、割合で74.5％に申告漏れ等がありました。4社に3社近い水準です。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)
この数字は、普段どおり処理している案件でも、価格申告や加算要素の整理が甘いと簡単に指摘対象になることを示しています。意外ですね。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)

調査の目的は単に追徴課税ではなく、不適正申告の是正と今後の適正申告の指導です。そのため、指摘事項の背景説明や再発防止の視点まで見られます。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
通関業従事者としては、申告時点の正確性だけでなく、後から説明できる証跡の並び方まで含めて準備しておくと強いです。書類の筋道が重要です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

輸入事後調査の通知と例外

実地の調査は原則として事前通知があり、電話などで日時、場所、対象貨物、調査目的などが伝えられます。ただし、何日前かは法令で一律に決まっていません。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
税関は、準備ができるよう相当の時間的余裕を置くとしています。事前通知が基本です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
一方で、通知すると違法・不当行為を容易にしたり、正確な税額把握が困難になるおそれがある場合は、事前通知なしで臨場することがあります。ここは誤解されやすい点です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

つまり、「必ず数週間前に連絡が来る」と決めつけるのは危険です。無通知は例外ですが、制度上はあります。 aog-partners(https://aog-partners.com/yunyuzigochousahazizennitutigatodokutohakagirimasen/)
通知後の日時変更は、一時的な入院、親族の葬儀、業務上やむを得ない事情など合理的理由があれば協議可能です。日程変更だけ覚えておけばOKです。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
通関実務では、決算や大量入港の週に無理に受けるより、担当資料をそろえられる日に調整したほうが、説明ミスや提出漏れを減らせます。時間損失の回避になります。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

ここで見落としやすいのが、通知された対象年だけしか見られないとは限らない点です。たとえばX年申告の適否を確認するために、それ以前の帳簿書類の提示を求められることがあります。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
さらに、調査の途中で類似の非違が過去年にも及ぶ疑いが出た場合、当初通知事項以外へ調査が広がることもあります。対象拡大に注意すれば大丈夫です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
このため、通知書に書かれた期間だけファイルを集める運用だと足りません。関連契約や送金証跡を年をまたいで束ねておくと、現場での混乱を抑えやすいです。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

調査通知の部分で役立つ公式Q&Aです。通知なし調査の例外、日時変更、対象拡大の扱いがまとまっています。
税関｜輸入事後調査手続に関するQ＆A

輸入事後調査の書類と実地確認

実地調査では、輸入許可書、インボイス、運賃明細、保険料明細、包装明細、契約書、会計帳簿などの通関・会計資料が確認されます。紙だけではありません。 skadvisory(https://skadvisory.jp/ftacustoms/customs_audit_support/)
電磁的記録の場合、画面表示での提示や、プリントアウト、媒体へのコピー提出を求められることがあります。電子保存も対象です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
輸入事後調査では、現場で説明できる人とデータを出せる人が分かれていると詰まりやすいです。ここが盲点ですね。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

税関は、必要があれば帳簿書類の提示・提出を求められ、正当な理由なく拒んだり虚偽書類を出した場合は、1年以下の懲役または50万円以下の罰金の対象になり得ます。書類対応は軽く見られません。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
さらに、私物名義でも事業関連性が疑われれば提示・提出の対象になり得るとされています。名義だけで切れません。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
このため、会社口座と個人口座、立替精算、無償支給部材、後払いロイヤルティの線引きが曖昧だと、調査時間が一気に延びます。整理が基本です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

特に実務で指摘されやすいのは、加算要素の申告漏れ、特殊関係者間取引、無償提供した部材、インボイス外の支払い、原産地関連です。申告書だけ見ても分からない論点が多いです。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)
令和6事務年度の公表では、申告漏れ事例の主因として、インボイスは正しいのに申告が誤っているケースが約87％を占めました。書類があるだけでは足りないということですね。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)
つまり、通関業従事者が見るべきなのは「書類の有無」より「申告価格への反映漏れがないか」です。結論は価格設計です。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)

この場面の対策としては、加算要素の見落とし防止が狙いなので、申告前チェックリストを1枚に固定する方法が有効です。候補は、関税評価の確認項目を一覧化した社内チェックシートを案件ごとに保存する運用です。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)
調査で見られる書類範囲の公式整理はここが参考になります。事業所訪問、帳簿確認、ICT活用調査まで確認できます。
税関｜事後調査等

輸入事後調査の修正申告と税額

調査終了時に非違があると判断されると、税関は内容を説明し、原則として修正申告を勧奨します。勧奨はありますが、応じるかは任意です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
応じない場合は更正処分に進みます。ただ、応じなかったこと自体で基本的に不利取扱いはないとされています。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
ここで重要なのは、修正申告のタイミングによって過少申告加算税率が変わる点です。金額差が出ます。 customs.go(https://www.customs.go.jp/tetsuzuki/c-answer/imtsukan/1305_jr.htm)

税関から調査通知を受けた日の翌日以後、更正予知前に修正申告した場合、過少申告加算税は増加税額の5％です。更正予知後や増額更正では10％になります。 customs.go(https://www.customs.go.jp/tetsuzuki/c-answer/imtsukan/1305_jr.htm)
さらに、増加税額が当初申告税額または50万円のいずれか多い金額を超える部分には、追加で5％相当が加算されます。差は小さくありません。 customs.go(https://www.customs.go.jp/tetsuzuki/c-answer/imtsukan/1305_jr.htm)
たとえば不足税額が100万円なら、5％と10％では加算税だけで5万円差です。はがき数枚の計算ミスが、月末の粗利を削ります。 customs.go(https://www.customs.go.jp/tetsuzuki/c-answer/imtsukan/1305_jr.htm)

悪質と判断されると、重加算税は過少申告ベースで35％、無申告ベースで40％となり、延滞税も別途かかります。ここまで行くと法的リスクが一気に重くなります。 komon-lawyer(https://komon-lawyer.net/law/other/274/)
さらに、事後調査の過程で悪質な輸入者と判明した場合は、犯則調査に移行し、脱税事件として告発される場合もあります。痛いですね。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)
「どうせ指摘後に直せば同じ」と考えるのは危険です。通知後の初動でコスト差が出るのが実務です。 komon-lawyer(https://komon-lawyer.net/law/other/274/)

なお、修正申告に応じた後でも、後から誤りがあると考えれば更正の請求は可能です。更正の請求期間は原則5年です。 customs.go(https://www.customs.go.jp/tetsuzuki/c-answer/imtsukan/1305_jr.htm)
一方で、修正申告をするとその申告自体に不服申立てはできません。判断前に論点整理が条件です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
この場面の対策は、争点の切り分けが狙いなので、関税評価や原産地の論点を通関士や関税実務に強い専門家へ1回だけ確認する方法です。候補は、通知書とサンプル申告書を並べて論点メモを作る運用です。 skadvisory(https://skadvisory.jp/ftacustoms/customs_audit_support/)

加算税率や更正の請求期間を確認するなら、税関の案内が最も実務向きです。
税関｜納税申告に誤りがあった場合（修正申告、更正の請求）

輸入事後調査で差がつく独自視点の対応

検索上位の記事では、流れの説明で終わるものが多いです。ですが現場で差が出るのは、調査当日の受け答えより前の「社内の置き方」です。そこが本質です。 foresight(https://www.foresight.jp/tsukanshi/column/post-survey/)
税関Q&Aでは、調査に立ち会って輸入者の代わりに主張・陳述を業として行うのは原則として通関業務に当たり、通関業者等しか行えないと整理されています。立会い役の選定は自由ではありません。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
つまり、総務や経理だけで場を回そうとすると、説明できる人はいても、通関論点を切り返せないまま調査が進むことがあります。人選が原則です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)

もう一つの差は、税関に渡す資料を「時系列」で出すか、「論点別」で出すかです。価格加算、無償支給、ロイヤルティ、特殊関係、EPAの5束くらいに分けるだけで、説明の往復が減ります。これは使えそうです。 skadvisory(https://skadvisory.jp/ftacustoms/customs_audit_support/)
令和6事務年度では納付不足税額が148億8,929万円、追徴税額合計が157億799万円でした。全体で見れば、1件ごとの小さな見落としが巨大な総額になっています。 kannaikaikei(https://www.kannaikaikei.jp/news/15547)
通関業従事者にとっては、1申告の整合性だけでなく、同型案件を横串で見てミスを再発させない仕組みづくりが利益防衛につながります。つまり横展開です。 customs.go(https://www.customs.go.jp/shiryo/chousa.htm)

再調査についても誤解があります。いったん「更正決定等をすべきと認められない」通知を受けても、新たな情報で非違が判明すれば再調査はあり得ます。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
そのため、調査終了後にファイルを崩したり、経緯メモを捨てたりすると、次回の説明コストが跳ね上がります。保存に注意すれば大丈夫です。 cita110(https://cita110.com/uploads/8/5/5/6/85562182/posteriorisurveybycustoms201709.pdf)
あなたが今すぐやるなら、過去5年分の主要輸入案件を、申告価格・加算要素・原産地・送金証跡の4列で棚卸しするだけでも十分です。1回の棚卸しで、通知後の時間損失と追徴リスクをかなり減らせます。 aog-partners(https://aog-partners.com/zeikanzigotyousanokisotisiki/)